Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MLH3Q9UHC1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MLH3Q9UHC1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MLH3Q9UHC1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MLH3Q9UHC1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms