Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX1-2Q9UD57 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX1-2Q9UD57 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX1-2Q9UD57 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms