Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GALPQ9UBC7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GALPQ9UBC7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms