Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP35Q9P2H5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP35Q9P2H5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP35Q9P2H5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
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