Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC47.29■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC47.25■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.16
CCDC180Q9P1Z9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC47.25■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC47.25■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.24■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.22■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
CCDC180Q9P1Z9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC47.18■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC47.17■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC47.16■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC47.13■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC47.09■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms