Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CXXC1Q9P0U4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CXXC1Q9P0U4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CXXC1Q9P0U4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms