Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM9Q9P0T7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM9Q9P0T7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM9Q9P0T7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms