Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC59Q9P031 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC59Q9P031 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms