Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM39AQ9NV64 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM39AQ9NV64 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms