Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZCCHC3Q9NUD5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZCCHC3Q9NUD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZCCHC3Q9NUD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms