Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HOMER2Q9NSB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOMER2Q9NSB8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms