Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TM7SF3Q9NS93 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TM7SF3Q9NS93 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TM7SF3Q9NS93 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms