Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SEC31BQ9NQW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC31BQ9NQW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC31BQ9NQW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms