Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCUBE2Q9NQ36 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCUBE2Q9NQ36 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms