Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FANCFQ9NPI8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FANCFQ9NPI8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FANCFQ9NPI8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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