Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2TQ9NPD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2TQ9NPD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms