Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCNB1IP1Q9NPC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms