Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC4Q9HBW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC4Q9HBW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC4Q9HBW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms