Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN28AQ9H9Z2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN28AQ9H9Z2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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