Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF41Q9H4P4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF41Q9H4P4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RNF41Q9H4P4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms