Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMOC1Q9H4F8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMOC1Q9H4F8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMOC1Q9H4F8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms