Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M0

NUP62CL, Nucleoporin-62 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CLQ9H1M0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP62CLQ9H1M0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP62CLQ9H1M0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms