Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MKRN2Q9H000 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MKRN2Q9H000 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN2Q9H000 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms