Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP1Q9C000 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NLRP1Q9C000 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP1Q9C000 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms