Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TM6SF1Q9BZW5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM6SF1Q9BZW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM6SF1Q9BZW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM6SF1Q9BZW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM6SF1Q9BZW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TM6SF1Q9BZW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM6SF1Q9BZW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM6SF1Q9BZW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms