Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCO2Q9BYV7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BCO2Q9BYV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BCO2Q9BYV7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms