Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5DQ9BY66 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5DQ9BY66 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5DQ9BY66 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms