Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDCA4Q9BXL8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDCA4Q9BXL8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms