Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
JAM3Q9BX67 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JAM3Q9BX67 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms