Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BRIP1Q9BX63 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRIP1Q9BX63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms