Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPOQ9BU64 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CENPOQ9BU64 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CENPOQ9BU64 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms