Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms