Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NIPSNAP3BQ9BS92 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms