Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LPIN3Q9BQK8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LPIN3Q9BQK8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms