Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP1Q99575 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP1Q99575 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP1Q99575 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP1Q99575 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POP1Q99575 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POP1Q99575 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP1Q99575 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP1Q99575 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP1Q99575 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP1Q99575 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP1Q99575 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POP1Q99575 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POP1Q99575 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POP1Q99575 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POP1Q99575 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POP1Q99575 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP1Q99575 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP1Q99575 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP1Q99575 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POP1Q99575 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POP1Q99575 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP1Q99575 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POP1Q99575 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP1Q99575 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP1Q99575 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP1Q99575 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms