Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMD1Q99460 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMD1Q99460 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMD1Q99460 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms