Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNX18Q96RF0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX18Q96RF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX18Q96RF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms