Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARXQ96QS3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ARXQ96QS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms