Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MS4A4AQ96JQ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A4AQ96JQ5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms