Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCHS1Q96JQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCHS1Q96JQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCHS1Q96JQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms