Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRRIQ1Q96JM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRIQ1Q96JM4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRIQ1Q96JM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
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