Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MRPL48Q96GC5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPL48Q96GC5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MRPL48Q96GC5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms