Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINGO1Q96FE5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINGO1Q96FE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINGO1Q96FE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms