Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC126Q96EE4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms