Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC5Q96DU9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPC5Q96DU9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PABPC5Q96DU9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms