Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATG4CQ96DT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATG4CQ96DT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG4CQ96DT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms