Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGBD4Q96DM1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGBD4Q96DM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms