Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM43Q96BQ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM43Q96BQ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.1 ms