Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM143Q96AN5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM143Q96AN5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM143Q96AN5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms