Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UTP4Q969X6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UTP4Q969X6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms